Град Сандански е разположен в полите на пл. Пирин на 224 м. надморска височина и край устието на р. Санданска Бистрица. Градът отстои на почти еднакво разстояние от София и Солун и е важен център по международната магистрала Е 79.
Сандански е разположен амфитеатрално върху крайните югозападни склонове на Пирин планина по долното течение на река Санданска Бистрица. Географското му разположение по средата между Кресненското и Рупелското дефилета е предпоставка за изключително благоприятните му климатични особености. Град Сандански е климатичен и балнеоложки курорт с национално и международно значение, чийто микроклимат е лековит за редица заболявания, включително всички форми на бронхиална астма. Известен е с уникалния си климат и лековити минерални извори. Курорта се препоръчва и за лечение на различни белодробни заболявания, хронични ринити, синузити, неврологични заболявания, кожни алергии, някои бъбречни и урологични заболявания.